L’acquacoltura biologica è la forma di acquacoltura di produzione che soddisfa le specifiche che impongono determinati criteri di produzione chiamati “biologici” . È in un certo senso l’equivalente dell’acquacoltura con l’agricoltura biologica.
Le pratiche agricole utilizzate, tra cui l’alimentazione, la progettazione degli impianti, la densità di allevamento e la qualità dell’acqua, dovrebbero soddisfare le esigenze di sviluppo dei pesci e ridurre al minimo l’impatto ambientale negativo dell’azienda.